|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
ВЛИЯНИЕ ВЫБОРА ТРЕХМЕРНОЙ СТРУКТУРЫ БЕЛКА НА РЕЗУЛЬТАТЫ ВИРТУАЛЬНОГО СКРИНИНГА НА ПРИМЕРЕ БЕЛКА КАСПАЗА–7 Лизунов А.Ю. ФГУП «Научно-исследовательский институт прикладной акустики»; ул. 9 Мая, д. 7А, г. Дубна Московской области, 141980; al_bio@mail.ru В работе рассматриваются шесть различных структур белка каспаза–7 из Protein Data Bank. Между структурами вычисляется расстояние, определяемое как среднеквадратичное расстояние между соответствующими атомами активных сайтов белковых структур после совмещения. С помощью программы Алгокомб производится виртуальный скрининг набора веществ в выбранные структуры. Показано, что несмотря на малое расстояние между выбранными структурами, результаты виртуального скрининга в эти структуры качественно отличаются. Ключевые слова: виртуальный скрининг, влияние начальных данных, зависимость от начальных данных, докинг, влияние структуры белка, каспаза–7. |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
